系统发生学 

系统发生学希臘語φυλογένεσηφύλο现代希腊语fílo——种系、宗族;γεννήση,现代希腊语:jénnissi——起源,血统[1]。英语:phylogenetics,又称 种系发生学谱系发生学,简称 谱系学,是研究及推理生物个体或群体(例如物种种群)间演化史及关系的科学方法,属于系统分类学的一部分。

系统发生学的推理方法,通常在性状演变的特定模型下,评估可观察到的遗传性状(例如DNA序列或生物形态)来“假定”这些生物间的关系。这种分析推理方法的结果,就是 系统发生(英语:phylogeny,也称为 系统发生树 phylogenetic tree)——可显示一群生物演化史的关系图解假说[2]。系统发生树的尖端可以是生物体或化石,且代表演化谱系中的现今生物或“末端”生物。

利用系统发生学来分析种系的基本原则是:两个演化支具有“相同的性状状态”是它们对于“共有祖先同一状态”的保留;而现存生物的性状就是演化史的纪录,可作为重建演化史的依据。由系统发生分析的原则,建构了支序分类学的基本逻辑;而系统发生分析已成为理解生物多样性、演化、生态学和基因组的核心。

系统发生学这个概念不单止用于生物种系的发生與发展,还会用在系统分类学各个层面的分类单元上面。它也会被用到某一性状在种系发生过程中的演化这一方面。

註:生物分类学是生物的识别、命名和分类,它通常由系统发生学提供丰富的信息,但两者仍然是在方法论和逻辑上不同的学科[3]

  1. ^ Liddell英语Henry George Liddell, Henry George英语Henry George Liddell; Scott英语Robert Scott (philologist), Robert; Jones, Henry Stuart英语Henry Stuart-Jones. A Greek-English lexicon 9. Oxford: Clarendon Press. 1968: 1961. 
  2. ^ phylogeny. Biology online. [2013-02-15]. (原始内容存档于2013-03-31). 
  3. ^ Edwards AWF英语A. W. F. Edwards; Cavalli-Sforza LL英语Luigi Luca Cavalli-Sforza. Reconstruction of evolutionary trees. Heywood, Vernon Hilton; McNeill, J. (编). Phenetic and Phylogenetic Classification. 1964: 67–76. OCLC 733025912. Phylogenetics is the branch of life science concerned with the analysis of molecular sequencing data to study evolutionary relationships among groups of organisms. 



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