Rosetta@home 

Rosetta@home
原作者大衛·貝克英语David Baker (biochemist)團隊
开发華盛頓大學貝克實驗室
最初发布时间2005年10月6日​(2005-10-06
开发状态活躍
项目目标蛋白質結構預測
蛋白質設計英语Protein design
操作系统Microsoft Windows
麥金塔操作系統
Linux
Android
平台BOINC
使用语言英語
许可学术使用和非營利使用免费
商业使用须签署商业协议[1]
截止时间2023-04-02
平均表现225,041吉
活跃用户数36,726
总用户数1,363,584
活跃主机数249,673
总主机数529,112
网址boinc.bakerlab.org/rosetta 編輯維基數據鏈接

Rosetta@home是一个基于伯克利开放式网络计算平台(BOINC)的分布式计算项目,由华盛顿大学贝克实验室英语David Baker (biochemist)开发和维护,用于蛋白质结构预测蛋白质-蛋白质对接和新的蛋白质设计英语Protein design的研究。截至2015年2月12日,全球共有5万多台计算机是这一项目的活跃志愿者,平均每秒浮點運算次數达87万亿(87.688 teraFLOPS)。[2]Rosetta@Home还开发了一款电子游戏Foldit,目的是通过众包途径来实现上述研究目标。尽管这个项目很大程度上侧重于进行提高蛋白质组学方法的精确性和稳固性的基础研究,它也进行一些关于艾滋病疟疾癌症阿兹海默病以及其他疾病的病理学的应用研究。[3]

与其他BOINC项目一样,Rosetta@home使用志愿者的计算机中空闲的进程资源来执行单独的单元计算。计算结果会被发送到项目的中央服务器,经验证後存入数据库中。这个项目是跨平台的,支持多种不同的软件計算機硬件环境。用户可通过Rosetta@home的屏幕保护程序观看正在自己计算机上进行的蛋白质结构预测的情况。

除了疾病相关研究,Rosetta@home网络还是结构生物信息学中新方法的一个测试框架。这些新方法经Rosetta@home庞大且多样的用户群体使用後,若运行效果稳定,将会被用于其他基于Rosetta的应用程序,例如RosettaDock人类蛋白质组折叠项目英语Human Proteome Folding Project(HPF)。新方法测试中的两个重要项目是蛋白质结构预测技术的关键测试(CASP)和交互作用预测的关键测试英语Critical Assessment of Prediction of Interactions(CAPRI)。这两项测试实验分别用于评估蛋白质结构预测和蛋白质-蛋白质对接预测的最前沿技术。Rosetta@home稳居最重要的对接预测器之一,并且是现有最好的蛋白质三级结构预测器之一。[4]

  1. ^ UW TechTransfer Home : Digital Ventures : UW Technology : Express Licenses : Rosetta. UW TechTransfer. [2009年1月8日]. (原始内容存档于2012年2月16日) (英语). 
  2. ^ Rosetta@home - Credit overview. boincstats.com. [2015年2月12日]. (原始内容存档于2011年10月7日) (英语). 
  3. ^ Rosetta@home是什么?. 华盛顿大学. [2009年1月8日]. (原始内容存档于2008年9月13日) (中文). 
  4. ^ Lensink, Marc F.; Méndez, Raúl; Wodak, Shoshana J. Docking and scoring protein complexes: CAPRI 3rd Edition. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 2007-10-05, 69 (4): 704–718 [2022-05-01]. PMID 17918726. doi:10.1002/prot.21804. (原始内容存档于2022-05-01) (英语). 



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